Porté par la Région de Franche-Comté pour la France et le Canton de Neuchâtel pour la Suisse, le projet détude porte sur les possibilités damélioration en matière de transport ferroviaire entre Besançon et Neuchâtel, à la fois du point de vue de la fréquentation et des infrastructures. Confrontées à la problématique des travailleurs frontaliers et à la saturation des axes de transport routier et ferroviaire, les régions française et suisse sont toutes deux vivement intéressées aux améliorations possibles à apporter à la Ligne des Horlogers et à la liaison Besançon - Neuchâtel via Pontarlier.